SMILES 기반 Molecule Graph 구조 설계를 통한 IUPAC 명명 시스템 구축

I Don't Know Chemistry, But I'm Building a Chemical Namer Anyway

Dagger Shoe2026년 6월 21일4분intermediate

AI 요약

Context

화학식 표현을 위한 독자적 포맷 설계 시도로 인해 모든 Edge Case 대응 실패 및 시스템 복잡도 증가라는 한계 직면. 표준 규격 부재로 인한 데이터 호환성 결여 및 단일 개발자의 구현 가능 범위를 초과하는 설계 오버헤드 발생.

SMILES 표준 포맷 채택을 통한 입력 인터페이스 단일화 및 검증된 Regular Grammar 활용
SMILES 문자열을 Token 단위로 분리하여 Atom 정점과 Bond 간선으로 구성된 Molecule Graph 객체로 변환하는 파서 설계
Element(화학 데이터), Atom(그래프 노드), Molecule(컨테이너), SMILESParser(구문 분석기)로 분리된 책임 중심의 클래스 구조 설계
괄호 밸런싱 및 Ring Number 매칭 확인을 통한 전처리 단계의 구문 검증 로직 구현
원자별 최대 Valence(원자가) 체크를 통해 그래프의 물리적 타당성을 검토하는 Validation 레이어 구축

실천 포인트

1. 도메인 데이터 모델링 시 업계 표준 포맷 존재 여부를 최우선으로 검토

2. 복잡한 문자열 파싱 시 [Tokenizing -> Graph Transformation -> Validation] 단계로 파이프라인 분리

3. 비즈니스 로직 진입 전 선형 시간(Linear Time) 복잡도의 기본 유효성 검증 단계 배치

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